阿里云免费向全球机构开放病毒检测技术

2020年7月12日 Off By quoitpits.com

中新网3月13日电 3月13日,阿里云对外宣布,将向全球医疗科研机构、疾控中心等一线病毒研究机构免费开放云上病毒比对服务,可大幅提升病毒基因检测效率,最快只需60秒即可完成包括新冠病毒在内的任意病毒基因对比工作,对进一步了解病毒变异提供有效依据。这是继此前宣布AI算力免费后,阿里云再次用技术“抢夺”宝贵时间。

病毒经过数代传播,会产生变异,追踪掌握病毒变异情况成为科研人员的重中之重。宏基因组测序mNGS是目前较为有效的追踪方案,配合病毒库可精准确定病毒的代际关系,甚至找到病毒源发地。

贵州省第五批援鄂医疗队院感工作人员 何隽:这里面是百宝箱,有浴帽、用来在他们鞋套损坏的情况下套上。棉球是等他们出来洗耳朵用,棉签用来洗鼻(腔)。

目前,国内基因公司安诺优达已开始借助阿里云的计算能力从某肿瘤样本数据中寻找病毒相关序列的数据,用于研究病毒活动与某肿瘤发生的相关性。

当何隽一行到达更衣室时,已经有15 位医护人员在此等待。他们来自贵州省不同的医院,不同的科室。但此刻,他们带着同样的任务进到病区,肩负着同样的使命,有着同样的期盼。

此次阿里云免费开放的基因计算服务AGS(Alibaba Genomics Service),采用容器技术和GPU,即开即用,可同时运行多个病毒基因比对服务,大大缩短了这一进程,60秒内即可获取高质量的基因比对报告,为患者提供更为准确的医疗方案。

医生:等一会儿我拿进去,放这里吧老师。

这一天,在江汉方舱医院,贵州医疗队的24名医护人员要看护200名患者。除了正常的治疗,还有很多琐碎的工作。这会儿何隽就在指导患者如何正确戴口罩。

累计收到港澳台地区通报确诊病例84例:香港特别行政区56例(出院1例,死亡1例),澳门特别行政区10例(出院3例),台湾地区18例(出院1例)。

包括疾控中心、各大高校、医院、基因企业等一线病毒研究机构可在阿里云上申请快速开通基因计算服务,为进一步研究病毒蛋白质及变异提供准确的数据支撑。

贵州省第五批援鄂医疗队院感工作人员 何隽:管天管地管空气,院感就是啥都管。我们的空气,我们的物表、地面,保洁也要管,医护人员也要管,垃圾转运也要管,所有的操作都要管。如果你不把这部分做好,假设有一个人感染了,这一群人都不安全。

在更衣室里,何隽忙着检查队员们防护服穿戴的情况,提醒他们做好保护,不要将皮肤裸露出来。而在医护人员进入病区前,何隽还会进行最后一遍检查,包括他们的防护服、手套、口罩、护目镜等防护设备的气密性,随后将23名医护人员一个一个送进舱内,自己紧随其后,开始一天的工作。

但此前的mNGS数据分析较为耗时,以某新冠重症患者为例,系统需要对2200万个序列超过32亿个碱基一一和病毒库比对,检测出新冠病毒特征区域的完全匹配系列,通常这一过程需要30分钟或更久。

贵州省第五批援鄂医疗队院感工作人员 何隽:带子拉开,然后(上下)拉开,然后用两个手把鼻子夹紧,然后戴口罩之前要洗手……

湖北新增确诊病例2420例(武汉1923例),新增治愈出院病例912例(武汉486例),新增死亡病例139例(武汉107例),现有确诊病例48175例(武汉34289例),其中重症病例10152例(武汉8335例)。累计治愈出院病例4774例(武汉2502例),累计死亡病例1457例(武汉1123例),累计确诊病例54406例(武汉37914例)。新增疑似病例1216例(武汉507例),现有疑似病例5534例(武汉2265例)。

贵州第五批援鄂医疗队院感工作人员 何隽:医护人员保护了病人,谁又来保护医护人员?医护人员也需要保护,因为我们院感就是保证他们的生命安全,让他们放心大胆往前走,去做自己该做的事情。让疫情扩散范围尽量缩小、尽量减少,我们也能早日战胜病魔。

何隽是随贵州省第五批援鄂医疗队来武汉的,近半个月的时间里,她每天都是凌晨5点起床,然后开始准备医疗队进入方舱医院的物资。记者和她一起数了一下,防护服、口罩、酒精、隔离衣等,一共有二十多种。

清晨六点半,接送医护人员的大巴车准时停在驻地酒店的门口,何隽带着百宝箱随医疗队一同前往江汉方舱医院。从驻地酒店到江汉方舱医院,大约有20多公里的路程,队员们每天都是摸黑上车,到天蒙蒙亮才能到达位于武汉国际会展中心的江汉方舱医院。

截至2月14日24时,据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告,现有确诊病例56873例(其中重症病例11053例),累计治愈出院病例8096例,累计死亡病例1523例,累计报告确诊病例66492例,现有疑似病例8969例。累计追踪到密切接触者513183人,尚在医学观察的密切接触者169039人。

贵州省第五批援鄂医疗队院感工作人员 何隽:(这件)防护服太大了,这个地方要弄小一点儿,要不这里全是空的,这个隔离衣是不行的。这样,我先拿我的这个隔离衣给你们,到时候采咽试纸的时候看见我们的医护人员也给他们穿。